Магистрантский семинар – обязательное занятие для всех магистрантов первого и второго года (студентов 1 и 2 курсов магистратуры), целью которого является способствовать освоению студентами основных навыков научного исследования и таким образом помочь им в написании их магистерских квалификационных работ, в подготовке к текущим магистрантским отчетам и к участию в ежегодной студенческой богословской конференции ПСТГУ. На семинаре студенты знакомятся с методами и жанрами научного исследования, анализируют труды известных ученых и свои собственные квалификационные работы и доклады, а также обсуждают и освещают в своих обзорах и рецензиях текущие события научной жизни. Аспиранты могут принимать участие в работе семинара в качестве научной и педагогической практики.