Монографии:

• Русская Зарубежная Церковь в первой половине 1920-х годов. Организация церковного управления в эмиграции и его отношения с Московской Патриархией при жизни Патриарха Тихона. М.: ПСТГУ. 2007. – 398 с.
• Архиепископ Серафим (Соболев): жизнь, служение, идеология. – М.: Издательство «ФИВ». 2011. – 264 с.
• Русская Зарубежная Церковь в 1925 – 1938 гг. Юрисдикционные конфликты и отношения с московской церковной властью. М.: ПСТГУ. 2011. – 624 с. (2-е изд. 2012)
  а) Жизнеописание архиепископа Серафима (Соболева). София: Подворье Патриарха Московского и всея Руси в Софии, Синодальное издательство БПЦ. 2011. – 196 с.
  б) Жизнеописание на архиепископ Серафим (Соболев). София: Подворие на Патриарх Московски и на цяла Русия в София; Синодално издателство на БПЦ. 2011 (на болгарском яз.) – 196 с.
  в) Sfântul Serafim Din Sofia. Ocrotitorul elevilor şi al studenţilor. Bucureşti: Editura Areopag. 2020 (на румынском языке) – 288 с.
• Русская Зарубежная Церковь в 1939 – 1964 гг. Административное устройство и отношения с Церковью в Отечестве. М.: ПСТГУ. 2015. – 488 с. (2-е изд. 2018).
• Пламень огненный. Жизнь и наследие архиепископа Серафима (Соболева). М.: Издательство Сретенского монастыря. 2015. – 320 с.
• Из истории взаимоотношений Русской и Константинопольской Церквей в ХХ веке. М.: ПСТГУ. 2017 (совместно с иереем А. Мазыриным). – 376 с.

Учебные пособия:

• Лекции по истории Русской Церкви (1917 – 2008). М.: ПСТГУ. 2018. – 368 с.

Научные публикации документов и материалов:

• Шавельский Г., протопр. В школе и на службе. Воспоминания. М. – Брюссель: Conference Sainte Trinite du Patriarcat de Moscou ASBL; Екатерининский мужской монастырь. 2016 / Кострюков А. Вступ. статья, подготовка текстов, комментарии, именной указатель.

• История иерархии Русской Православной Церкви. Комментированные списки иерархов по епископским кафедрам с 862 г. М.: ПСТГУ. 2019. (в коллективе авторов)

Научные статьи и публикации в журналах, рекомендованных перечнем ВАК:

• Русская Зарубежная Церковь и указ патриарха Тихона об упразднении заграничного Высшего Церковного управления // Отечественная история. 2007. № 5. сентябрь-октябрь. С. 72 – 86 (1,2 п.л.)
• К вопросу о политических воззрениях русского епископата в эмиграции в начале 20-х гг. ХХ века // Вестник Российского университета дружбы народов. Серия «История России». 2007. № 4. С. 92 – 98 (1 п.л.).
• Ставропольский Собор 1919 г. и организация Временного Высшего Церковного управления на Юго-востоке России // Уральский исторический вестник. 2008. № 4 (21). С. 71 – 75 (0,5 п.л.). Опубликовано также:
• Ставропольский Собор 1919 г. и организация Временного Высшего Церковного управления на юге России // Православная жизнь. 2009. № 5 (685). С. 1 – 11.
• Предпосылки участия архиепископа Серафима (Соболева) во Всеправославном Совещании 1948 года // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2010. Вып. 2 (35). С. 52 – 60.
• Русская Зарубежная Церковь и автокефалия Польской Церкви // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2010. Вып. 4 (37). С. 17 – 27.
• К истории разделения между Московской Патриархией и Североамериканской митрополией в 1933 г. // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2011. Вып. 3 (40). С. 46 – 58.
• Новые сведения о взглядах архиепископа Богучарского Серафима (Соболева) на проблемы Русской Православной Церкви // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2011. Вып. 5 (42). С. 124 – 133.
• Русская Зарубежная Церковь и Патриарший местоблюститель митрополит Петр (Полянский) // Клио. 2011. № 2 (53). С. 84 – 87. (0,56 п.л.).
• К истории взаимоотношений между Русской Зарубежной Церковью и Константинопольской Патриархией в 1920 – 1924 гг. // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2011. Вып. 6 (43). С. 58 – 69. (0,75 п.л.).
• Русская Зарубежная Церковь и обновленческий раскол в 1920 – 1930-е годы // Вестник Челябинского государственного университета. История. Вып. 48. 2011. № 34 (249). С. 84 – 89 (0,43 п.л.). Опубликовано также:
• Русская Зарубежная Церковь и обновленческий раскол в 1920 – 1930-е годы // Первые церковно-исторические Митрофановские чтения в ВГУ. Воронеж: Воронежский государственный университет. Воронежская духовная семинария. 2012. С. 183 – 194.
• Русская Зарубежная Церковь и обновленческий раскол в 1920 – 1930-е годы // Историко-религиоведческие исследования. Воронеж: ВГУ. 2014. № 1. С. 87 – 97.
• Обстоятельства разделения между Русской Зарубежной Церковью и митрополитом Евлогием в 1926 г. // Ярославский педагогический вестник. Том 1 (Гуманитарные науки). 2011. № 4. С. 69 – 77. (0,77 п.л.).
• Л.Н. Парийский о церковной ситуации в Америке в середине 1940-х гг. // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2012. Вып. 6 (49). С. 65 – 118. (3,25 п.л.).
• К вопросу о подготовке канонизации царской семьи в Русской Зарубежной Церкви // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2013. Вып. 3 (52). С. 42 – 51. Опубликовано также:
• Споры о церковном отпевании и канонизации Императора Николая II в Русской Зарубежной Церкви // Дом Романовых в истории. Материалы международной научно-богословской историко-краеведческой конференции. Пятые Феодоритовские чтения. Мурманск – Санкт-Петербург: Ладан. 2013. С. 353 – 361. (0,3 п.л.)
• Споры о церковном отпевании и канонизации Императора Николая II в Русской Зарубежной Церкви // Северный благовест. 2013. № 27. С. 60 – 66
• Экзарх Болгарской Церкви митрополит Стефан и Московская Патриархия // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2013. Вып. 5 (54). С. 31 – 43.
• К истории воссоединения с Московским Патриархатом приходов Западноевропейского экзархата в послевоенные годы (1945 – 1946) // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2013. Вып. 6 (55). С. 72 – 84.
• Епископ Нолинский Александр (Малинин): забытый исповедник // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2014. Вып. 2 (57). С. 82 – 89.
• «Чужой хлеб больше, чем горек…». Письма архимандрита Феодосия (Мельника) архимандриту Антонию (Синькевичу) // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2015. Вып. 5 (66). С. 115 – 140.
• О некоторых причинах неудачи православия западного обряда // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2016. Вып. 2 (69). С. 80 – 98.
• Дарование автокефалии Православной Церкви в Америке в свете документов церковных архивов // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2016. Вып. 3 (70). С. 93 – 103. Опубликовано также в:
• Дарование автокефалии Православной Церкви в Америке в свете новых материалов // Покровские чтения в Брюсселе: материалы ежегодной международной научной конференции. Вып. 1, 2. – М. – Брюссель: Conference Sainte Trinite du Patriarcat de Moscou ASBL; Екатерининский мужской монастырь. 2017. С. 102 – 110.
• Начало «духовной весны» или восхождение на Голгофу? (проблемы 1917 года на страницах периодической печати военно-духовного ведомства) // Свет Христов просвещает всех. Альманах Свято-Филаретовского Православно-христианского института. Вып. 25. Зима 2018. С. 28 – 42.
• Святитель Серафим (Соболев) и «Дело князя Лобанова-Ростовского» (публ., вступ. ст., и коммент.) // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2018. Вып. 82. С. 107 – 134.
• Подготовка Московского совещания глав и представителей поместных православных Церквей 1948 г. // Российская история. 2019. № 1. С. 197 – 206.
• «Врачу, исцелися сам» (Лук. 4.23). Профессор С.В. Троицкий против «восточного папизма» Константинополя (вступ. ст., публ. и примеч.) // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2019. Вып. 87. С. 141 – 148.
• Отношение Русской Зарубежной Церкви к инославию при митрополите Филарете (Вознесенском) // Вестник Свято-Филаретовского института. 2020. Вып. 35. С. 248 – 269. 
• К вопросу о взаимоотношениях Сербской и Русской Зарубежной Церквей в 1960 – 1980-е гг. // Вестник ПСТГУ. II: История. История Русской Православной Церкви. 2020. Вып. 92. С. 144 – 157.
• Предоставление автокефалии Православной Церкви в Америке и московско-константинопольские отношения // Российская история. 2020. № 3. С. 148 – 155. 
• Кострюков А.А. Позиция Русской Зарубежной Церкви по вопросу о благодатности Московской Патриархии при митрополите Филарете (Вознесенском) // Вестник ПСТГУ. Серия II: История. История Русской Православной Церкви. 2021. Вып. 98. С. 130–142

• Военное духовенство и развал армии в 1917 году // Церковь и время. 2005. № 2 (31). С.143-198.
• О некоторых условиях служения военного духовенства в годы Первой Мировой войны // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2005. Вып. I. С. 24-44.
• 1). Митрополит Евлогий (Георгиевский) и патриарший указ об упразднении Зарубежного ВЦУ от 5 мая 1922 года (№ 348/349) // ХV Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы 2005. Т.1. М. ПСТГУ. 2005. С.318-327.
  2). Митрополит Евлогий (Георгиевский) и Патриарший указ об упразднении зарубежного ВЦУ // ЖМП. 2006. № 12. С. 75 – 81.
  3). Митрополит Евлогий (Георгиевский) и патриарший указ об упразднении Зарубежного ВЦУ от 5 мая 1922 года (№ 348/349) // Церковно-исторический вестник. 2005-2006. № 12-13. С. 58-66.
• Протопресвитер Георгий Шавельский и Карловацкий Синод // Церковь и время. 2006. № 1 (34). С.134-151.
• Русские военные священники в немецко-австрийском плену в годы Первой Мировой войны // Церковь и время. 2006. № 2 (35). С.109-118.
• Архипастырь русского рассеяния // Митрополит Антоний (Храповицкий). Архипастырь русского рассеяния. Джорданвилль. Свято-Троицкая духовная семинария. 2006. С. 39 – 42.
• 1) Преодолевший разделение. К жизнеописанию архиепископа Серафима (Соболева) // Церковь и время. 2006. № 3 (36). С. 98-115.
  2) Между Москвой и Карловцами. К жизнеописанию архиепископа Серафима (Соболева) // Церковь в истории России. Сб. 8. М.: Российская академия наук. Институт Российской истории. 2009. С. 363 – 378.
  3) Преодолевший разделение. К жизнеописанию архиепископа Серафима (Соболева) // Образ жизни. 2010. № 1 (7). С. 26 – 33.
• Борьба зарубежных иерархов с демократическими тенденциями в церковном управлении в двадцатые годы ХХ века // ХVI Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы 2006. Т.1. М. ПСТГУ. 2006. С. 123 – 129.
• Участие епископа Серафима (Соболева) в реорганизации заграничного церковного управления в 1922 – 1923 годах // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2006. Вып. 3 (20). С. 47 – 59.
• К истории служения военного духовенства в годы Русско-японской войны // Православная культура в России: прошлое и настоящее (по материалам Вторых Свято-Филаретовских чтений). М. Пашков дом. 2007. С. 135 – 145.
• История Русского церковного разделения // ЖМП. 2007. № 7. С. 82 – 95 (совместно с прот. Н. Балашовым).
• Мнения представителей русской эмиграции о Церковном управлении заграницей в первые месяцы после Патриаршего указа № 348 (349) // Церковь и время. 2007. № 2 (39). С. 183 – 232.
• 1). К истории взаимоотношений между Сербской Православной Церковью и Архиерейским Синодом в Сремских Карловцах // ХVII Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы 2007. Т.1. М. ПСТГУ. 2007. С. 244 – 249.
  2). К истории взаимоотношений между Сербской Православной Церковью и Архиерейским Синодом в Сремских Карловцах // Православная жизнь. 2009. № 2 (682). С. 1 – 14.
• Евлогий [Георгиевский] // Большая Российская энциклопедия. Т. 9. М.: БРЭ. 2007. С. 511 – 512.
• Особенности богослужения в действующей армии в начале ХХ века (об одном «свидетельстве» Н.Д. Жевахова) // Церковно-исторический вестник. 2007. № 14. С. 153 – 162.
• Принятие в юрисдикцию Московского Патриархата священнослужителей Русской Зарубежной Церкви в Югославии в 1945 г. // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2008. Вып. 2 (27). С. 75 – 84.
• Вопрос о цареубийстве и монархии с точки зрения высшей иерархии Русской Зарубежной Церкви в довоенный период // Император Николай II и его время. Сборник материалов Всероссийской научно-просветительской конференции с международным участием. Екатеринбург: Екатеринбургская епархия; ИИиА УрО РАН. 2008. С. 152 – 162.
• Скорби «строевого капитана» (военное духовенство в предреволюционную эпоху) // Материалы Международной научной конференции «1917-й: Церковь и судьбы России. К 90-летию Поместного Собора и избрания Патриарха Тихона». М.: ПСТГУ. 2008. С. 43 – 56.
• Временное Высшее Церковное управление на Юго-Востоке России как начало зарубежной церковной власти // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2008. Вып. 3 (28). С. 50 – 60.
• Новые документы по истории взаимоотношений между Патриархом Тихоном и Карловацким Синодом // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2008. Вып. 3 (28). С. 119 – 125.
• Деятельность Церковного управления на юго-востоке России в годы Гражданской войны // Гражданская война на Востоке России: Материалы Всероссийской научной конференции (г. Пермь, 25 – 26 ноября 2008 г.). Пермь. Пермский государственный архив новейшей истории. 2008. С. 163 – 170.
• Сербская Церковь и вопрос о правах Зарубежного Синода в конце Второй мировой войны // ХVIII Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы. Т.1. М.: ПСТГУ. 2008. С. 282 – 287.
• Западноевропейский экзархат русских православных приходов // Большая Российская энциклопедия. Т. 10. М.: БРЭ. 2008. С. 244 – 245.
• Изъятие церковных ценностей // Большая Российская энциклопедия. Т. 11. М.: БРЭ. 2008. С. 61 – 62.
• Иоанн Кронштадтский // Большая Российская энциклопедия. Т. 11. М.: БРЭ. 2008. С. 521.
• Новые документы к жизнеописанию архиепископа Сергия (Ларина). Воспоминания епископа Василия (Родзянко) и М.Е. Губонина // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2009. Вып. 1 (30). С. 123 – 150 (совместно с Н.А. Кривошеевой).
• От разделения к единству // Русская история. 2009. № 2 (4). С. 16 – 23.
• Какие полномочия получил архиепископ Евлогий (Георгиевский) в октябре 1920 года? // ХIХ Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы. Т.1. М. ПСТГУ. 2009. С. 270 – 273.
• Архиепископ Царицынский Дамиан (Говоров) и его просветительская деятельность в эмиграции // Церковно-исторический вестник. № 16 – 17. 2009/2010. М.: Издание Общества любителей церковной истории. С. 81 – 89.
• 1). Новые сведения о жизни и деятельности митрополита Сергия (Страгородского) в 1920 – 1930-е гг. // Православие в судьбе Урала и России: история и современность. Материалы Всероссийской научно-практической конференции (г. Екатеринбург, 18 – 20 апреля 2010 г.). Екатеринбург: ИИА УрО РАН; Издательство Екатеринбургской епархии, 2010. С. 329 – 334.
  2). Новые сведения о жизни и деятельности митрополита Сергия (Страгородского) в 1920 – 1930-е гг. (по материалам архива протоиерея Стефана Ляшевского) // ХХ Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы. Т.1. М. ПСТГУ. 2010. С. 312 – 316.
• Русская Зарубежная Церковь и преодоление «болгарской схизмы» // Троицкое наследие. 2010. № 1 (27). С. 14 – 17.
• Партия консерваторов в Болгарской Церкви и коммунистическая власть (к разоблачению одного укоренившегося мифа) // Троицкое наследие. 2010. № 2 (28). С. 18 – 25.
• Русская Зарубежная Церковь и Американская митрополия в 1920 – 1926 гг. // Троицкое наследие. 2010. № 4 (30). С. 54 – 65.
• 1). Пастырское служение архиепископа Серафима (Соболева) в Болгарии // Церковь и время. 2010. № 3 (52). С. 219 – 240.
  2). Архиепископ Серафим (Соболев) в Болгарии // Образ жизни. 2011. № 1 (10). С. 42 – 51.
• Обстоятельства разделения между Архиерейским Синодом РПЦЗ и Североамериканской митрополией // ХХI Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы. Т.1. М. ПСТГУ. 2011. С. 286 – 293. (0,67 п.л.).
• Протопресвитер Георгий Шавельский и вопрос о каноничности Белокриницкой иерархии // «А мне глаголати неленостно…» Раскол и старообрядчество в современной рефлексии: сб. науч. тр. Кострома: КГУ им. Н.А. Некрасова. 2012. С. 178 – 181.
• Взгляд Русской Зарубежной Церкви на государственное устройство России в довоенный период // ХХII Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. Материалы. Т.1. М.: ПСТГУ. 2012. С. 136 – 141.
• Отношение протопресвитера Георгия Шавельского к старообрядчеству // Труды преподавателей и выпускников Воронежской православной духовной семинарии. Вып. 6. Воронеж: Издательский отдел Воронежской православной духовной семинарии. 2012. С. 251 – 261.
• 1) Почему не состоялся диалог? К вопросу о взаимоотношениях между католичеством и церковными структурами русской эмиграции в 1920 – 1930-е гг. // Страницы. 2012. Т. 16. Вып. 3. С. 406 – 416.
  2) Римо-католичество и церковные структуры русской эмиграции: почему не состоялся диалог? // Россия и Ватикан: Вып. 3: Русская эмиграция в Европе и Католическая Церковь между двумя мировыми войнами / Под ред. Е.С. Токаревой, А.В. Юдина. М.: ЛЕНАНД. 2014. С. 125 – 136.
• Архиепископ Серафим (Соболев) и церковные проблемы современности // Москва. 2013. № 4. С. 224 – 236.
• Духовенство великой войны // Парфенон сегодня. 2013. № 4 (7). С. 16 – 23.
• Русская церковная эмиграция о Церковном управлении заграницей и полномочиях митрополита Антония после указа № 348 (349) // Metropolitan Antonii (Khrapovitskii). Archpastor of the Russian Diaspora. Jordanille: Foundation of Russian History. 2014. С. 331 – 348.
• а) Архиепископ Челябинский Гавриил (Чепур) – духовный преемник святых Кирилла и Мефодия (К 140-летию со дня рождения) // Двенадцатый Славянский научный собор «Урал. Православие. Культура». Кирилло-мефодиевская традиция: история в современности: материалы всероссийской научно-практической конференции / Сост. И.Н. Морозова. Челябинск: Челябинская государственная академия культуры и искусств. 2014. С. 55 – 63.
  б) Архиепископ Челябинский Гавриил (Чепур) и его наследие (к 140-летию со дня рождения) // Вестник церковной истории. 2015. № 3 – 4 (39 – 40). С. 282 – 289.
• Подвиг русского военного духовенства в годы Первой мировой войны // Журнал Московской Патриархии. 2014. № 7. С. 66 – 71.
• Загадка «владыки Иоанна» // Журнал Московской Патриархии. 2014. № 9. С. 50 – 53.
• Влияние русского монашества на церковную жизнь Болгарии в 1920 – 1940-е гг. // Древняя Русь: во времени, в личностях, в идеях. Παλαιορωσια: εν χρονω, εν προσωπω, εν ειδει. Альманах. Вып. 2: Материалы научной конференции «Преподобный Сергий Радонежский: личность в контексте эпохи и история его почитания». Санкт-Петербург, 1 – 3 октября 2014 г. / Под ред. к.и.н. свящ. К. Костромина. – СПб; Казань. 2014. С. 141 – 151.
• Свято-Троицкий монастырь в Джорданвилле – духовный центр русского православного зарубежья // Северный благовест. 2014. № 28. С. 40 – 45.
• Духовенство военное // Россия в Первой мировой войне. 1914 – 1918. Энциклопедия. В 3 т. / отв. ред. А.К. Сорокин. М.: Политическая энциклопедия. 2014. Т. 1. С. 651 – 653.
• Русское военное духовенство накануне войны // Первая мировая война: взгляд спустя столетие. Предвоенные годы. М.: МНЭПУ. 2014. С. 566 – 574.
• К вопросу о посмертном почитании архиепископа Серафима (Соболева) // Россия – Болгария. Образы духовного единства. София. Подворье Патриарха Московского и всея Руси в Софии (Болгария). 2015. С. 173 – 181.
• а) Русская Православная Церковь за границей и Великая Отечественная война // Макарьевские чтения: материалы Х Международной конференции (25 – 27 ноября 2015 года). Горно-Алтайск: РИО ГАГУ. 2015. С. 153 – 159.
  б) Идеология Русской Зарубежной Церкви в годы Второй мировой войны (правда и вымыслы) // Роль духовно-патриотической идеи в победе в Великой Отечественной войне 1941 – 1945 гг. М.: РИСИ. 2015. С. 120 – 131.
• Архиепископ Богучарский Серафим (Соболев). К 135-летию со дня рождения // Православный церковный календарь Воронежской митрополии. 2016. Издание Воронежской митрополии. 2015. С. 150 – 156.
• Житие на светител Серафим, архиепископ Богучарски, Софийски Чудотворец // Светител Серафим, архиепископ Богучарски, Софийски Чудотворец. Житие, аскетически поучения и проповеди. София: Подворие на Патриарх Московски и на цяла Русия в София; Синодално издателство на БПЦ. 2016 (на болгарском яз.) С. 19 – 60.
• Великое счастье служить // Журнал Московской Патриархии. 2016. № 4. С. 48 – 52.
• а) Протоиерей Стефан Ляшевский – пастырь, ученый, исповедник (к 30-летию со дня кончины) // Труды Перервинской православной духовной семинарии. № 14. М. 2016. С. 39 – 55.
  б) Протоиерей Стефан Ляшевский – пастырь, ученый, исповедник (к 30-летию со дня кончины) // Русская Старина. 2016. № 2. С. 137 – 146.
• О собрании проповедей протоиерея Валентина Амфитеатрова (совместно с Е.Н. Викторовой) // Собрание проповедей протоиерея Валентина Амфитеатрова. М.: Университет Дмитрия Пожарского. 2016. С. 13 – 20.
• Штрихи к портрету святителя Серафима: находки и перспективы // Православный Воронеж. 2016. № 9 – 10 (198 – 199). С. 10.
• Невыполненный завет митрополита Платона (К истории православия западного обряда) // Платоновские чтения, 1 декабря 2015: сб. матер. / Перервинская духовная. М.: ПДС. 2016. С. 20 – 28.
• От Владимира Святославича до Владимира Кирилловича (Русская Зарубежная Церковь и династический вопрос) // Северный благовест. 2016. № 29. С. 28 – 32.
• Забытые подвижницы: духовные дочери архиепископа Серафима (Соболева) // Северный благовест. 2016. № 29. С. 122 – 127.
• Пастырское служение архиепископа Серафима (Соболева) // Прославление и почитание святых в Русской Православной Церкви. XXIV Международные Рождественские образовательные чтения. Материалы конференции. М.: ПСТГУ. 2016. С. 40 – 46.
• Распоряжения Патриарха Тихона относительно Русской Зарубежной Церкви // ХХVI Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета: Материалы. М. Изд. ПСТГУ. 2016. С. 88 – 92.
• От воодушевления до полной растерянности. Русская армия и военное духовенство в 1917 году // ЖМП. 2017. № 9. С. 76 – 83.
• Архив протоиерея Стефана Ляшевского как источник по истории Русской Церкви и Северного Кавказа // Православие в истории и культуре Северного Кавказа: вопросы источниковедения и историографии. Материалы VII Международных Свято-Игнатьевских чтений. Вып. 1. Ставрополь: Издательский центр СтДС. 2017. С. 311 – 320.
• Свидетельство о вере и родине. Русская Православная Церковь за границей // Живая история. 2017. № 10. С. 42 – 47.
• Коммунистическое государство и Русская Зарубежная Церковь // Материалы церковно-научной конференции «100-летие начала эпохи гонений на Русскую Православную Церковь». Храм Христа Спасителя, г. Москва, 16 июня 2017. М.: Изд. Московской Патриархии Русской Православной Церкви. 2018 (160 с.). С. 79 – 91.
• Миссия и идеология Русской Зарубежной Церкви в первые послевоенные десятилетия // Русское Зарубежье – история и наследие: к 10-летию воссоединения РПЦ и РПЦЗ. М.: Феория. 2017. С. 48 – 55.
• Коммунистическое государство и Русская Зарубежная Церковь // Материалы церковно-научной конференции «100-летие начала эпохи гонений на Русскую Православную Церковь». Храм Христа Спасителя, г. Москва, 16 июня 2017. М.: Изд. Московской Патриархии Русской Православной Церкви. 2018 (160 с.). С. 79 – 91.
• Строить будут после меня. К 75-летию со дня кончины Патриарха Сергия (Страгородского) // ЖМП. 2019. № 6. С. 50 – 56.
• К вопросу о прославлении Русской Зарубежной Церковью инославных христиан // Православие в Балтии. 2020. № 9 (18). С. 73–80.
  
• Русская Зарубежная Церковь против канонических нарушений Фанара в 1920 – 1930-е  гг. // Причины и вызовы текущего кризиса межправославных отношений. Материалы научно-практической конференции (ПСТГУ 25 – 26 февраля 2019 года). М.: ПСТГУ. 2020.
  
• К истории взаимоотношений между Русской Зарубежной Церковью и катакомбным движением на родине в 1970 – 1980-х гг. // Церковь и время. 2020. № 1 (90). С 118 – 136.
  
• Первоначальный список новомучеников, подготовленный Русской Зарубежной Церковью для канонизации 1981 года // Церковь и время. 2020. № 2 (91). С. 51 – 116.
  
• Русская Зарубежная Церковь и антисоветское сопротивление на родине в 1960 – 1980 гг. //  Церква мученикiв: гонiння на вiру та Церква у ХХ столiттi: матерiали Мiжнародної наукової конференцїї (6 – 7 лютого 2020 р., Свята Успеньска Києво-Печерьска Лавра). Київ: Видавничий вiддiл Української Православної Церкви. 2020. С. 379 – 389.
  
• «Незапятнанная архиерейская совесть». Жизнь и мученическая кончина митрополита Бориса (Разумова) // ХХХ Ежегодная богословская конференция Православного Свято-Тихоновского гуманитарного университета. М.: ПСТГУ. 2020. С. 129 – 134.
  
• К истории канонизации новомучеников и исповедников Российских в Русской Зарубежной Церкви // Церковь и время. 2020. № 4 (93). С. 161 – 182.
  
• Горький урок. Последние годы служения митрополита Серафима (Лукьянова) // VII Валаамские образовательные чтения. «Богоизбранная обитель»: к 30-летию возрождения монашеской жизни на Валааме»: материалы международной конференции (17-19 мая 2019 г., Валаам). Валаамский монастырь; ПКПЦ «Свет Валаама» - М.: Изд. «Перо». 2020. С. 194 – 201.
  
• Зарубежное Высшее церковное управление в Константинополе // ЖМП. 2021. № 3. С. 68–73.
  
• Проблемы каноничности русского западноевропейского экзархата и Североамериканской митрополии в свете Московско-Константинопольских отношений в 1960 – 1970-е гг. // Единство Церкви в предании, истории и современности. Материалы научной конференции 14 – 16 ноября 2019 г. М. ПСТГУ. 2021. С. 262–279.
  

Рецензии:

• «Истины Христовой светлые служители» [Рец.:] Доненко Н., протоиерей «Новомученики Михаил Богословский, Виктор Киранов, Александр Ильенков; Город в годы воинствующего атеизма, 1919 – 1939» – Феодосия; М.: Издат. дом «Коктебель», 2006. – 224 с.: ил. – (Образы былого. Вып. 7) // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2007. Вып. 2 (23). С. 183 – 187.
• Церковное подполье ХХ века как предмет исторического исследования. [Рец.:] Беглов Алексей. В поисках «безгрешных катакомб». Церковное подполье в СССР. М.: Издательский Совет Русской Православной Церкви, «Арефа». 2008. 352 с. // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2009. Вып. 2 (31). С. 135 – 141.
• «Носитель благодати и наследия Святой Руси». [Рец.:] Корнилов А. Монах от Оптиной до Платины. Жизнь епископа Сеаттлийского Нектария (Концевича). Нижний Новгород. 2008. // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2009. Вып. 3 (32). С. 161 – 164.
• [Рец.:] Корнилов А.А. «Переправимся на ту сторону…» Деятельность православного духовенства в лагере перемещенных лиц Шляйсгайм (1945 – 1951 гг.). Н. Новгород; Мюнхен. 2011 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2012. Вып. 5 (48). С. 141 – 145.
• [Рец.:] Болотов С.В. Русская Православная Церковь и международная политика СССР в 1930-е – 1950-е годы. М.: Издательство Крутицкого подворья. Общество любителей церковной истории, 2011. 315 с. // Российская история. 2012. № 5. С. 205 – 208.
• [Рец.:] Щеглов Г.Э. Хранитель. Жизненный путь Федора Михайловича Морозова. Минск: Врата. 2012 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2013. Вып. 2 (51). С. 142 – 144
• Церковное нормотворчество. Новый сборник правовых актов Русской Православной Церкви заграницей [Рец.:] Законодательство Русской Православной Церкви Заграницей. 1921 – 2007 / Сост. Анашкин Д.П. М.: Изд-во ПСТГУ. 2012 // ЖМП. 2013. № 2. С. 104 – 105
• Я не верю в смерть. Если вы меня убьете – я буду жить. Новый сборник по истории гонений на Русскую Православную Церковь. [Рец.:] Судебный процесс против саратовского духовенства в 1918 – 1919 гг. / Публикация А.И. Мраморнова. – М.: Изд-во Новоспасского монастыря; Саратов: Издательство Саратовской митрополии. 2013 // ЖМП. 2013. № 6. С. 104 – 105.
• Мощи святых – свидетели гонений. [Рец.:] Кашеваров А. Советская власть и судьбы мощей православных святых. СПб.: Наука. 2013 // ЖМП. 2015. № 1. С. 90 – 91.
• «Памяти Господней добрый хранителю». [Рец.:] Бирюкова Ю.А., Овчинников П., свящ. Подвиг священномученика Захарии (Лобова), епископа Аксайского, архиепископа Воронежского и Задонского (1865 – 1937). Ростов-на-Дону: Антей, 2014 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2015. Вып. 3 (64). С. 157 – 160.
• «Нам не нужны ни старая, ни новая Церковь…» Церковные расколы в Донской области в 1920-1930-е гг. Сборник документов и материалов / Л.В. Табунщикова, А.В. Шадрина – Ростов-на-Дону: Антей. 2015 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2016. Вып. 3 (70). С. 141 – 145.
• «Церковь снова будет светом во тьме…» [Рец.:] Ершова А.А. «В тюрьме в 1920 году». Воспоминания. М.: Культурно-просветительский фонд «Преображение». Свято-Филаретовский православно-христианский институт. 2017 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2017. Вып. 76. С. 141 – 144.
• «Наступает время творческого собирания всех живых духовных сил». Рец. на: Юго-Восточный Русский Церковный Собор 1919 года / Сб. документов под ред. Ю. Бирюковой. М. Изд. Новоспасского монастыря. 2018 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2017. Вып. 82. С. 149 – 152.
• «Пора нам опомниться, чтобы получить от Господа прощение» [Рец. на: Юго-Восточный Русский Церковный Собор 1919 года / Сб. документов под ред. Ю. Бирюковой. М. Изд. Новоспасского монастыря. 2018] // ЖМП. 2018. № 8. С. 85 – 86.
• Православная Сибирь в преддверии «Хамодержавия». Рец. на: Белоус П.В. Тобольская епархия в годы Первой мировой войны (1914 – 1918). Тюмень: Издательство Тюменского государственного университета, 2018 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2019. Вып. 90. С. 151 – 154.
• О служении архиепископа Иоанна на Пензенской земле. Рец. на изд.: Зелёв С.В., Аристова К.Г. Священномученик Иоанн (Поммер). Пензенский период служения (1918 – 1921). Пенза. 2018. // ЖМП. 2020. № 5. С. 81–83.
  
• Новая страница в истории северного монашества. Рецензия на книгу: Шевченко Т.И. Валаамские иноки в эпоху гонений: Московское подворье Валаамского монастыря  и его насельники после революции 1917 года. М.: Изд-во ПСТГУ. 2018. 272 с.  // Вестник Екатеринбургской духовной семинарии. 2020. № 3 (31). С. 379 – 386.
  
• Кострюков А. А. Как не потеряться в «джунглях зилотства»?// Вестник ПСТГУ. Серия II: История. История Русской Православной Церкви. 2020. Вып. 94. С. 173-176. — Рец. на кн.: Бочков П., свящ. Обзор неканонических православных юрисдикций ХХ–ХХI вв. СПб: Свое издательство. 2018. Т. 1–4. Изд. 2-е, испр. и доп. 
• «Капля в океане скорби». Рец. на: Пученков А., Калиновский В. Духовный форпост России. Православное духовенство Крыма в 1914 – 1920 годах. СПб.: Владимир Даль. 2020 // Вестник ПСТГУ. Серия II: История. История Русской Православной Церкви. 2021. Вып. 99. С. 165 – 168.
  

Учебно-методические работы:

• a) Учебные материалы по программе профессиональной переподготовки «Теология». Ч. 2. М.: ПСТГУ. 2008 (в коллективе авторов).
  б) Учебно-методические материалы по программе профессиональной переподготовки «Теология». 2-е издание, исправленное и дополненное. М: ПСТГУ. 2012 (в коллективе авторов).
  в) Учебно-методические материалы по программе профессиональной переподготовки «Теология». 3-е издание, исправленное и дополненное. М: ПСТГУ. 2016 (в коллективе авторов).
• Учебные материалы по программе профессиональной переподготовки «Теология». Для слушателей вечерней формы обучения на 2010 – 2011 г. М.: ПСТГУ. 2010. (в коллективе авторов).
• Актуальные проблемы истории Русской Православной Церкви (История Русской Зарубежной Церкви). Программа курса. М.: Издательство ПСТГУ. 2011.
• Учебно-методические материалы по программе «Теология». Церковная история и каноническое право (совместно с А.Л. Дворкиным и Е.В. Сильверстовой). М. Изд. ПСТГУ. 2020.

Прочие публикации:

• Уголок России на Американском континенте // Православная Москва. 2011, декабрь. № 24 (498). С. 9
• «Красный владыка» русского зарубежья. Митрополит Вениамин (Федченков) и его административная миссия // НГ религии. 2011, 21 декабря № 22 (304). С. 6.
• Что такое мученичество за Христа? // Жизнь во Христе. 2013. Октябрь. С. 50.
• Забытые герои // Генерал Скобелев / сост. Р.Г. Гагкуев. – 2-е изд., испр. и доп. М.: Информационное агентство «Белые воины»; Издательский дом «Достоинство». 2013. С. 621 – 625.
• а) Культ Сталина: обновленчество или язычество? // «Православный» сталинизм. Вопросы и ответы. М.: «Символик», РИСИ. 2016. С. 112 – 121.
  б) Культ Сталина: обновленчество или язычество? // «Православный» сталинизм. Сб. статей. М.: «Символик». 2017. (2-е издание). С. 220 – 230.
  в) Культ Сталина: обновленчество или язычество? // Православная Русь. 2015. № 3. С. 2 – 4.

Публикации в интернете:

• О восстановлении общения между Зарубежным Синодом и Болгарской Православной Церковью // http://www.sedmitza.ru/text/1058735.html
• Русское военное духовенство в 1917 году // http://www.sedmitza.ru/text/406287.html
• Неизвестные страницы истории русского военного духовенства // http://www.sedmitza.ru/text/406641.html
• Протопресвитер Г. Шавельский и Карловацкий Синод // http://www.pobeda.ru/content/view/4273/10/
• Скорби «строевого капитана» // https://www.miloserdie.ru/article/skorbi-stroevogo-kapitana
• Военные священники в сонме новомучеников и исповедников Российских // http://www.pravoslavie.ru/put/44668.htm
• Митрополит Евлогий (Георгиевский): упущенные возможности // http://www.pravoslavie.ru/arhiv/32824.htm
• Протоиерей Стефан Ляшевский как свидетель исповеднического служения патриарха Сергия (Страгородского) // http://www.sedmitza.ru/text/1223142.html
• Архиепископ Царицынский Дамиан (Говоров) и его просветительская деятельность в эмиграции // http://history-mpda.orthodoxy.ru/
• Служение протопресвитера Георгия Шавельского в эмиграции // www.sedmitza.ru/text/2501045.html
• Последние годы земного служения архиепископа Серафима (Соболева) //www.sedmitza.ru/text/2641816.html
• Архиепископ Серафим (Соболев) о принципах церковного управления // http://podvorie-sofia.ru/arhiepiskop-serafim-sobolev-o-printsipah-tserkovnogo-upravleniya/
• Архиепископ Серафим (Соболев) и церковные проблемы современности // http://www.bogoslov.ru/text/3125679.html
• Скорби «строевого капитана» (Военное духовенство в предреволюционную эпоху) .// http://www.miloserdie.ru/index.php?ss=20&s=22&src=6337
• Участие епископа Серафима (Соболева) в реорганизации заграничного церковного управления в 1922–1923 годах // http://rusk.ru/st.php?idar=22520
• Деятельность Церковного управления на юго-востоке России в годы Гражданской войны // http://www.permgani.ru/publikatsii/konferentsii/grazhdanskaya-vojna-na-vostoke-rossii/a-a-kostryukov-deyatelnost-tserkovnogo-upravleniya-na-yugo-vostoke-rossii-v-gody-grazhdanskoj-vojny.html
• Партия консерваторов в Болгарской Церкви и коммунистическая власть // http://rusk.ru/st.php?idar=43818
• Архиепископ Челябинский Гавриил (Чепур) и его наследие // www.pravoslavie.ru/put/76249.htm
• Распоряжения Патриарха Тихона относительно Русской Зарубежной Церкви // https://rusk.ru/st.php?idar=79373
• Русская Зарубежная Церковь и коммунистическое государство // http://www.pravoslavie.ru/105173.html
• Об отношении Русской Зарубежной Церкви ко Второй мировой войне // http://www.pravoslavie.ru/108286.html
• Штрихи к портрету святителя Серафима (Соболева): находки и перспективы // https://rusk.ru/st.php?idar=77346
• Щрихи към портрета на свети Серафим (Соболев): нови открытия и перспективи (на болгарском языке) // http://www.globalorthodoxy.com/2017-09-03-17-27-24/68553-rihi-kym-portreta-na-svetiti-serafim-sobolev-otkritiia-i-perspektivi
• Русская Зарубежная Церковь и династия Романовых // http://www.pravoslavie.ru/114425.html
• Ради исторической справедливости. Русская Зарубежная Церковь и кирилловская ветвь Дома Романовых //http://www.stoletie.ru/territoriya_istorii/radi_istoricheskoj_spravedlivosti_610.htm

• Написать историю Русской Зарубежной Церкви без уклонения вправо или влево // http://rusk.ru/st.php?idar=114101
• Какво не знаем за архиеп. Серафим (Соболев) (на болг. языке) //         http://www.bg-patriarshia.bg/reflections.php?id=264
• Оболганная война // Спас. 2013. № 3. С. 4.
• Я думаю, это действительно великий святой // http://httpwww.pravoslavie.ru/91654.html
• Царский путь святителя Серафима // Православный Воронеж. 2016. № 5 – 6 (194 – 195). С. 10 – 11.
• При Сталине был бы порядок? // http://www.pravmir.ru/pri-staline-byil-byi-poryadok/
• У человека часто бывает слишком прямолинейное представление об истории // http://orthodox.education/interview-2017-kostrukov/
• Церкви была объявлена война. Историк Андрей Кострюков об антицерковных декретах советской власти. // http://www.pravoslavie.ru/110358.html
• Власть опасалась, что Церковь уйдет в подполье. Историк Андрей Кострюков об антицерковных декретах советской власти // http://www.pravoslavie.ru/110380.html

• Фирсов С. Разрушение ложных стереотипов. [Рец. на: ] Кострюков А. Русская Зарубежная Церковь в первой половине 1920-х годов. Организация церковного управления в эмиграции и его отношения с Московской Патриархией при жизни Патриарха Тихона. М.: ПСТГУ. 2007 // Церковь и время. 2008. № 1 (42). С. 244 – 256.
• Бирюкова Ю.  Рец. на: Кострюков А. Русская Зарубежная Церковь в 1939 – 1964 гг. Административное устройство и отношения с Церковью в Отечестве. М.: ПСТГУ. 2015 // Православная культура вчера и сегодня. Olsztyn. Centrum Badan Europy Wschodniej. 2015. С. 371 – 376.
• Корнилов А. Рец. на: Кострюков А. Русская Зарубежная Церковь в 1939 – 1964 гг. Административное устройство и отношения с Церковью в Отечестве. М.: ПСТГУ. 2015 // Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2016. № 2 (69). С. 155 – 159. 
• Обозный К. Рец. на: Кострюков А. Русская Зарубежная Церковь в 1939 – 1964 гг. Административное устройство и отношения с Церковью в Отечестве. М.: ПСТГУ. 2015 // Российская история. 2016. № 4. С. 196 – 201.
• Бирюкова Ю. Рец. на: Кострюков А. Русская Зарубежная Церковь в 1939 – 1964 гг. Административное устройство и отношения с Церковью в Отечестве. М.: ПСТГУ. 2015 // Российская история. 2016. № 4. С. 202 – 204.
• Корнилов А. Рец. на: Кострюков А. Пламень огненный. Жизнь и наследие архиепископа Серафима (Соболева). М.: Издательство Сретенского монастыря. 2015 //  Вестник ПСТГУ. II. История Русской Православной Церкви. 2016. № 6 (73). С. 148 – 152.
• Серебрич А.А. Двойная игра Константинополя. Рец. на книгу: Мазырин А. (свящ.), Кострюков А.А. Из истории взаимоотношений Русской и Константинопольской Церквей в ХХ веке. М. ПСТГУ. 2017. // Проблемы национальной стратегии. 2018. № 2 (47) С. 249 – 254. 
• Кацис Л. Заметки читателя историко-философской литературы. V – VI. Митрополит Евлогий и «Пансион Мобэр» В. Парнаха.  Рец. на: Священник А. Мазырин, А.А. Кострюков Из истории взаимоотношений русской и константинопольской церквей в ХХ веке. М., 2017; В.Я. Парнах. Пансион Мобер. Воспоминания / Вступительная статья П. Нерлера. Публикация и комментарии П. Нерлера и А. Парнаха. Подготовка текста П. Нерлера, Н. Поболя и О. Шамфаровой // Дисапора  VII. Новые материалы. Париж; СПб, 2018.
• Чибисова А.А. «История о том, как московский квартирный вопрос Вселенскую Патриархию испортил». Рец. на: Мазырин А., свящ., Кострюков А.А. Из истории взаимоотношений Русской и Константинопольской Церквей в ХХ веке. М.: Издательство ПСТГУ, 2017. 376 с. // Вестник Екатеринбургской духовной семинарии. 2018. № 1 (21). С. 450 – 454.
• Корнилов А. А. Драматичная, трагическая и спасительная история Русской Церкви в новом учебном пособии ПСТГУ. Рец. на кн.: Кострюков А.А. Лекции по истории Русской Церкви (1917 – 2008). М. Изд-во ПСТГУ, 2018.
• Корнилов А.А. Своеобразие дипломатии Константинопольской Церкви в отношениях с Русской Православной Церковью в ХХ столетии. [Рец. на:] Мазырин А., свящ., Кострюков А.А. Из истории взаимоотношений Русской и Константинопольской Церквей в ХХ веке. М.: Издательство ПСТГУ, 2017. 376 с. // Христианское чтение. 2019. № 2. С. 205 – 210.
• Калягин А.К. «Новейшей истории Русской Церкви посвящается». Рец. на кн.: Кострюков А.А. Лекции по истории Русской Церкви (1917 – 2008): учебное пособие. М.: Изд-во ПСТГУ, 2018, 368 с. // Вестник Екатеринбургской духовной семинарии. 2020. № 1 (29). С. 347 – 352.