Web of Sciense:

• Ваганова Н.А. Дионисийство и софийность. Онтология и антропология женственности в проекте художественной религии Вячеслава Иванова // Вопросы философии. 2018. № 10. С. 128-139.

ВАК:

• Ваганова Н.А. Гносеология или мистагогия?  Концепция живой религии в творчестве о. Павла Флоренского // Вестник ПСТГУ. Серия I: Богословие. Философия. Религиоведение. 2018. Вып. 75. С. 67-78.
• Ваганова Н.А. «Дионисийская религия» Вячеслава Иванова как предмет науки о религии (к постановке проблемы) // Религиоведение. 2018. № 2. С. 162-169.

Статьи:

• Духовная музыка в высшей школе (Прот. Сергий Булгаков и хор Парижского Свято-Сергиевского института в 1930-е годы) // Этика и культура межличностных отношений в образовательном пространстве вуза. Материалы научно-практической конференции в ГМПИ имени М.М. Ипполитова-Иванова. 2-4 апреля 2003 г. М., 2003
  
• С.Н. Булгаков: Религиозно-философский путь. Международная научная конференция, посвященная 130-летию со дня рождения. 5-7 марта 2001 г. М., Русский путь, 2003. Рецензия // Вопросы философии, 2004. № 1. С. 184-186
  
• Мифологические представления о мудрости и их реминисценции в философских текстах С.Н. Булгакова. Рукопись. Деп. в ИНИОН РАН № 58374
  
• B.C. Соловьев - С.Н. Булгаков: эстетические аспекты софиологии. Рукопись. Деп. в ИНИОН РАН № 58373
  
• С.Н. Булгаков - византийский гуманист XX века. Сб. научн. трудов Православного Свято-Тихоновского Богословского института. М., 2004
  
• С.Н. Булгаков: софиология без Софии. Католическое искушение и отход от софиологической темы в крымский период творчества. Сб. научн. трудов Православного Свято-Тихоновского Богословского института. 2 (18). М., 2007
  
• Песни и пляски зла. Метафизика зла в творчестве Д.Д. Шостаковича. Журнал «Филармоник» № 1. М., 2007
  
• Александр Кожев. Атеизм и другие работы. Вестник ПСТГУ 1 (21). М., 2008
  
• Теодицея Лейбница и роман Ф.М. Достоевского «Братья Карамазовы». XVIII ежегодная Богословская конференция ПСТГУ. Т. 1. Материалы. М.,2008
  
• А.Н. Радищев – П.А. Флоренский: два путешествия. Вестник ПСТГУ 3 (27). М., 2009
  
• «Храмовая завеса» епископа Клойнского: об одном софийном мотиве в «Улиссе» Джойса и софиологии С.Н. Булгакова // Софиология. М.. 2010
  
• С.Н. Дурылин и Н.А. Римский-Корсаков. Музыкально-философский контрапункт // С.Н. Дурылин и его время. Книга первая. Исследования. М., 2010
  
• Дионисийство как прахристианство в книге Вяч. Иванова «Дионис и прадионисийство» // Вестник ПСТГУ. 4 (32). 2010
  
• Софийная онтология С.Н. Булгакова. Специальный курс. Учебно-методические материалы. М., ПСТГУ, 2010
  
• Метафизика и историософия русской музыкальной драмы. Специальный курс. Учебно-методические материалы. М., ПСТГУ, 2010
  
• «Я даже не знаю, что у нас в России» (мировоззренческие и философские истоки интерпретации роман Достоевского «Игрок» Сергеем Прокофьевым) // Ценности и смыслы. № 6 (15), 2011. С. 47-64
  
• N. Vaganova. Le fonti platoniche della cultura russa e l´ “ascetismo laico” del l´intelligencija russa // “Vechi” Pietre miliari del pensiero religioso russo 1909-2009. Atti del Simposio svoltosi a Roma, il 26 febrario 2009 con la partecipazione del Pontificio Istituto Orientale (Roma) e dell´ Universita ortodossodi S. Tichon (Mosca). Pontificio Istituto Orientale. Roma, 2012. С. 75-92.
  
• Ваганова Н.А. А.Н. Радищев – П.А. Флоренский: два путешествия // Философия, богословие и наука как опыт цельного знания. Сборник статей по итогам юбилейной конференции, посвященной П.А. Флоренскому (1882-1937), МГУ-МДА, 2007 / Под ред. О.М. Седых. М.: МАКС Пресс, 2012.
  
• Ваганова Н.А. Трансцендентальный идеал Канта и софиология Булгакова // Софиология и неопатристический синтез: Два богословских итога философского развития / Сборник материалов секции русской философии Международной богословской конференции ПСТГУ 2011 г. М., 2013. ISBN 978-5-7429-0816-6
  
• Vaganova Natal´ja. «Il cadaver della belezza» cento anni dopo // Il destino della Belezza. La Belezza nella prospettiva delle scienze umanistiche / Conferenza Internazionale. Universita San Tichon (Mosca, 17-19 aprile 2012) il colloborazione con l´Universita Catolilica del Sacro Cuore di Milano. Bari, 2013
  
• Ваганова Н.А. Таинство, догмат и антиномия в софиологии прот. С. Булгакова // Вестник ПСТГУ. Серия I. Богословие. Философия. I:4 (48). М., 2013. С. 40 – 51. ISBN 978-5-7429-0852-4
  
• Ваганова Н. "Труп красоты" столетие спустя // Chrześcijaństwo a współczesne koncepcje człowieka /Pod red. Lucjana Suchanka. – Krakow: Polska Akademia Umiejętności, 2013. S. 163-171.
  
• Natal’ja Vaganova. Ikonenmalerei in der Krise? // Religion und Gesellschaft in Ost und West 41, 3 (2013). S. 17-19
  
• Ваганова Н.А. «Оживут ли кости сии?», или Кто кого хватает… [Электронный ресурс] http://www.bogoslov.ru/text/3197959.html
• Vaganova Natalia. “The only pity is that his philosophical letters are addressed to the Lady”... Letters to a Lady as a philosophical genre // Peter Chaadaev: between the love of fatherland and the love of truth. Book of abstracts / International Conference Krakow Meetings. June 5-6 2016. Krakow. 2016. S. 73.
  
• Vaganova Natalia. Between image and enigma. On philosophical meanings of «art history» of E. Trubetskoy and others // Evgenii Trubetskoi. Icon and Philosophy / Ed. by Teresa Obolevitch and Randall A. Poole. Washington: Wipf and Stock Publishers, 2021. P. 173–180.
  

Научно-методические

• Ваганова Н.А. Софийная онтология С.Н. Булгакова. Специальный курс. Учебно-методические материалы. М., ПСТГУ, 2010
• Ваганова Н.А. Метафизика и историософия русской музыкальной драмы. Специальный курс. Учебно-методические материалы. М., ПСТГУ, 2010
  
• Ваганова Н.А. София в изгнании (о. Сергий Булгаков: эмиграция и возвращение к софиологии) // Вестник ОГУ. № 2 (58), 2014. С. 118-123. ISSN 1998-2720
• Ваганова Н.А. Воля к Софии и церковность в творчестве о. Павла Флоренского // Вестник ПСТГУ. № 5 (55), 2014. С. 81-91. ISBN 978-5-7429-0922-4

Статьи в сборниках:

• Ваганова Н.А. А. Н. Шмидт как софийный эзотеризм в книге «Столп и утверждение Истины» о. Павла Флоренского // «Философствовать в религии». Сборник материалов конференции, посвященной столетию выхода книги «Столп и утверждение Истины» о. Павла Флоренского. ПСТГУ, 2014.  М., 2017. С. 75-94. ISBN 978-5-7429-1084-8.
• Ваганова Н.А. Об особенностях противопоставления софиологии В.С. Соловьева и С.Н. Булгакова в рецепции и критике Е.Н. Трубецкого // Русский Логос: горизонты осмысления. Материалы международной научной конференции. В 2 т. Т.1. Классическая русская философская традиция. СПб, 2017. С. 99-104. ISBN 978-5-88812-856-5
  
• Ваганова Н.А. Гностическая мистификация, футуристический след и символистский контекст в «Софии земной и горней» Л.П. Карсавина // ЗНАЧЕНИЕ – СМЫСЛ - СИМВОЛ – II. Теология, философия и эстетика на рубеже веков. Материалы научной конференции 26-28 сентября 2017 г. Мцхета, Грузия. С. 49-51. ISBN 978-5-1909-8
  
• Ваганова Н.А. Изображения икон Софии Премудрости Божией в книге отца Павла Флоренского «Столп и утверждение Истины»: источники и их современное состояние // VIII Международная конференция АКТУАЛЬНЫЕ ПРОБЛЕМЫ ТЕОРИИ И ИСТОРИИ ИСКУССТВА. Тезисы докладов. Москва 2–6 октября 2018 г. М., 2918. С. 293-296/
  
• Ваганова Н.А. Концепция телимонотеизма Вячеслава Иванова и религиозная мистерия будущего // Вячеслав Иванов. Исследования и материалы. Вып. 3. / Сост. С. В. Федотова, А. Б. Шишкин. М.: ИМЛИ, 2018. С. 136-143.
• Ваганова Н.А. Изображения икон Софии Премудрости Божией в книге о. Павла Флоренского «Столп и утверждение истины»: источники и их современное состояние // Сборник трудов VIII научной конференции «Новгород и Новгородская земля. Искусство и реставрация». Великий Новгород, 2019. С. 37-54.
  
• Ваганова Н.А. Трансцендентальный идеал Канта и софиология Булгакова // Сергей Николаевич Булгаков / под. ред. А.П. Козырева – М.; Политическая энциклопедия. 2020 (Философия России первой половины ХХ века). М., 2020. С. 46-67.
  
• Ваганова Н.А. Догмат и антиномия в философии С.Н. Булгакова // Сергей Николаевич Булгаков / под. ред. А.П. Козырева – М.; Политическая энциклопедия. 2020 (Философия России первой половины ХХ века). М., 2020. С. 290-304.
  

Публикации

• Ваганова Н.А. Апокалиптика и теургия в русской религиозно-философской мысли нанкануне 1917 года // .Н. Толстой и Ф.М. Достоевский: задачи христианства и христианство как задача. Международная научная конференция. 2-5 октября 2011 года. Тула: Музей-усадьба Л.Н. Толстого «Ясная Поляна», 2014. С. 247-281.
• Ваганова Н.А. София в изгнании (о. Сергий Булгаков: эмиграция и возвращение к софиологии) // Вестник ОГУ. № 2 (58), 2014. С. 118-123. ISSN 1998-2720
• Ваганова Н.А. Воля к Софии и церковность в творчестве о. Павла Флоренского // Вестник ПСТГУ. № 5 (55), 2014. С. 81-91. ISBN 978-5-7429-0922-4
• Ваганова Н.А., Филиппов А.А Загадки Сергея Прокофьева // Художественное образование и наука. 2015. № 4. С. 130-135.
• Ваганова Н.А., Филиппов А.А. Песни и пляски зла: метафизика зла в творчестве Д. Д. Шостаковича // Художественное образование и наука. 2015. № 1. С. 117-121
• Ваганова Н.А. Представления о генезисе мифа в раннем творчестве Соловьева. Миф как теогония // Вестник ПСТГУ. № 2. 2016. С. 55-72.
• Ваганова Н.А. Гносеология или мистагогия? Концепция живой религии в творчестве о. Павла Флоренского // Вестник ПСТГУ. Серия I: Богословие. Философия. Религиоведение. 2018. Вып. 75. С. 67-78.
• Vaganova Natalia. Russian Sophiology and the Problem of the Subject in Modern Philosophy// Beyond Modernity. Russian Religious Philosophy and Post-Secularism. Ed. by Artur Mrowczynski-Van Allen, Teresa Obolevitch, Pawel Rojek. Washington, WipfandStockPublishers, 2016. P. 86-97.
• Ваганова Наталья. «Жаль только, что его философические письма обращены к даме…» Письма к даме как философский жанр // Logosiethos. Numerspesjalny. 2016 (43). S. 197-212.
• Ваганова Н.А. А. Н. Шмидт как софийный эзотеризм в книге «Столп и утверждение Истины» о. Павла Флоренского // «Философствовать в религии». Сборник материалов конференции, посвященной столетию выхода книги «Столп и утверждение Истины» о. Павла Флоренского. ПСТГУ, 2014. М., 2017. С. 75-94. ISBN 978-5-7429-1084-8.
• Ваганова Н.А. Об особенностях противопоставления софиологии В.С. Соловьева и С.Н. Булгакова в рецепции и критике Е.Н. Трубецкого // Русский Логос: горизонты осмысления. Материалы международной научной конференции. В 2 т. Т.1. Классическая русская философская традиция. СПб, 2017. С. 99-104. ISBN 978-5-88812-856-5