Издательство ПСТГУ ежегодно выпускает четыре научных периодических издания: «Вестник ПСТГУ», выходящий в пяти сериях, «Филаретовский альманах», «Искусство христианского мира» и «Труды ежегодной богословской конференции».
«Вестник ПСТГУ» является средством массовой информации, предназначенным для публикации основных результатов диссертационных исследований на соискание ученой степени доктора и кандидата наук, результатов иных исследований по разрабатываемым в ПСТГУ научным направлениям, а также для публикации оригинальных научных материалов, представляющих интерес для социо-гуманитарной науки, имеющих теоретическую и практическую значимость. Предшественником «Вестника ПСТГУ» с 1997 по 2003 гг. был «Богословский сборник», в котором публиковались материалы по богословию, библейской филологии, религиозной философии и церковной истории. Все серии «Вестника ПСТГУ» входят в перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий ВАК.
«Филаретовский альманах» — научный ежегодник, предназначенный для публикации материалов, относящихся к жизни и деятельности святителя Филарета (Дроздова), митрополита Московского и Коломенского. Альманах выпускается с 2004 года, и на протяжении многих лет готовился группой по изучению наследия святителя Филарета, работающей в ПСТГУ. В данное время Альманах является периодическим изданием Центра Истории богословия и богословского образования. В нем выходят публикации источников и статьи по тематике Центра.
Ежегодник сборник научных статей «Искусство христианского мира» предназначен для публикации исследований и материалов по разным вопросам христианского искусства, от раннехристианского периода до наших дней. На страницах сборника находят место статьи по смежным вопросам широкого культурологического охвата. Каждый том ежегодника представляет собой обильно иллюстрированное издание в переплете с золотым тиснением. Работа над изданием сборника осуществляется силами Факультета церковных художеств.
«Труды ежегодной богословской конференции» являются сборником выступлений участников Ежегодной богословской конференции ПСТГУ, международного научного форума, организующего свою секционную работу в соответствии с ведущимися в университете научными исследовательскими проектами. В работе над изданием ежегодного сборника принимают участие все факультеты и научные подразделения. ПСТГУ.
«Электронный научно-богословский журнал студентов и аспирантов Богословского факультета Православного Свято-Тихоновского Гуманитарного университета» призван информировать о важнейших событиях научной жизни студентов и аспирантов ПСТГУ, а также представить избранные студенческие и аспирантские работы, оформленные в виде статей, и отзывы научных руководителей и рецензентов на лучшие из защищенных дипломных работ. В журнале публикуются также отчеты студентов и аспирантов о своих зарубежных стажировках и об участии в научных конференциях. Предполагается выпускать журнал ежегодно, после защиты выпускных квалификационных работ. Все тексты студенческих и аспирантских работ публикуются в редакции научных руководителей.